Determination of homeodomain interacting protein kinase 2 polymorphisms rs2058265, rs6464214, and rs7456421 in patients with kidney stone

Cir Cir. 2023;91(4):474-478. doi: 10.24875/CIRU.22000472.

Abstract

Objective: This study aimed to investigate whether homeodomain interacting protein kinase 2 (HIPK2) polymorphism is associated with renal stone formation in a Turkish population.

Materials and methods: A total of 129 patients with calcium nephrolithiasis and 67 sex- and age-matched healthy controls were enrolled in the study. Blood samples were collected into EDTA tubes. The DNA of patients was extracted using a QIAsymphony® automated DNA isolation system. The Chi-square test was applied in the comparisons between the patient and control groups in respect of the differences in the genotype and allele frequencies.

Results: No statistically significant difference was found between the groups in terms of single nucleotide polymorphism (SNP) incidence in single allele and double alleles in the rs2058265 and rs6464214 regions (p = 0.13 and 0.37, respectively). The SNP incidence in double alleles in nephrolithiasis patients at rs7456421 was statistically significantly lower than in the control group (p = 0.001).

Conclusion: Distributions of the genotype and allele of the three polymorphisms (rs2058265, rs6464214, and rs745642 in HIPK2) were not associated with an increased risk of kidney stone in this Turkish population.

Objetivo: Investigar si el polimorfismo de la proteína cinasa 2 que interactúa con el homeodominio (HIPK2) está asociado con la formación de cálculos renales en una población turca.

Método: Se inscribieron en el estudio 129 pacientes con nefrolitiasis cálcica y 67 sujetos control sanos, emparejados por sexo y edad. Las muestras de sangre se recogieron en tubos con EDTA. El ADN de los pacientes se extrajo mediante un sistema de aislamiento de ADN automatizado QIAsymphony®. Se aplicó la prueba χ2 en las comparaciones entre los grupos de pacientes y control con respecto a las diferencias de las frecuencias genotípicas y alélicas.

Resultados: No se encontraron diferencias estadísticamente significativas entre los grupos en términos de incidencia de polimorfismo de nucleótido simple (PNS) en alelo simple y alelo doble en las regiones rs2058265 y rs6464214 (p = 0.13 y 0.37, respectivamente). La incidencia de PNS en alelos dobles en pacientes con nefrolitiasis en rs7456421 fue menor que en el grupo control, con una diferencia estadísticamente significativa (p = 0.001).

Conclusiones: Las distribuciones de genotipo y alelo de los tres polimorfismos (rs2058265, rs6464214 y rs745642 en HIPK2) no se asociaron con un mayor riesgo de cálculos renales en esta población turca.

Keywords: Alelo; Allele; Cálculo; Gen HIPK2; HIPK2 gene; Kidney; Nefrolitiasis; Nephrolithiasis; Polimorfismo; Polymorphism; Riñón; Stone.

MeSH terms

  • Alleles
  • Carrier Proteins
  • Genotype
  • Humans
  • Kidney Calculi* / genetics
  • Polymorphism, Single Nucleotide
  • Protein Serine-Threonine Kinases / genetics

Substances

  • HIPK2 protein, human
  • Carrier Proteins
  • Protein Serine-Threonine Kinases